Музеят развива партньорства с ключови институции от културната, социална и образователна системи, с които взаимодейства с цел да бъдат разработвани проекти в областта на музикалното изкуство, представяне творчеството на български композитори, млади творци и инструменталисти, майсторски класове и др.
Държавен културен институт къща музей „Панчо Владигеров” – София работи в партрньорство с НМА „Проф. Панчо Владигеров”, Нов български университет, фондация „Софийски музикални седмици”, БНР, БНТ, Музей на радиото към БНР, Музей „Борис Христов”, Музей за история на София – РИМ София, FM Classic и др.
